Ključna razlika med sestavljenim heterozigotom in dvojnim heterozigotom je v tem, da je sestavljeni heterozigot posameznik, ki ima dva različna mutirana alela na določenem genskem lokusu, medtem ko je dvojni heterozigot posameznik, ki je heterozigoten na dveh ločenih genetskih lokusih.
Na splošno ima gen dva alela, saj so organizmi diploidni. Aleli so variantne oblike gena. Nahajajo se v genetskem lokusu kromosoma. Obstajajo dominantni aleli in tudi recesivni aleli. Če ima posameznik dva različna alela (enega dominantnega in enega recesivnega (Aa)) za lokus, ga imenujemo heterozigota. Pogoj, da imamo dva različna alela za gen, se imenuje heterozigotno stanje. Sestavljeni heterozigot in dvojni heterozigot sta dve vrsti heterozigotnih situacij. Sestavljeni heterozigot ima dva različna mutirana alela na določenem genskem lokusu. Dvojni heterozigot je heterozigoten na dveh genskih lokusih.
