Ključna razlika med specifičnostjo substrata in specifičnostjo vezi je, da je specifičnost substrata sposobnost encima, da izbere natančno substrat, s katerim se lahko veže, iz skupine podobnih spojin, medtem ko je specifičnost vezi sposobnost encima, da izbere substrate s podobnimi vezmi in podobne strukture.
Izraza specifičnost substrata in specifičnost vezi spadata na področje biokemije glede aktivnosti encimov. Encim lahko definiramo kot biološki katalizator. To pomeni, da so encimi spojine, ki lahko povečajo stopnjo bioloških funkcij, ki potekajo v celicah, vendar se med funkcijo ne porabijo. Izraz specifičnost se nanaša na način, kako se določen encim veže na določen substrat.
