Ključna razlika med zooidogamijo in sifonogamijo je v tem, da je zooidogamija stanje, v katerem moške spolne celice plavajo v vodi, da dosežejo svoje ženske spolne celice, medtem ko je sifonogamija stanje, v katerem so razvite cevke cvetnega prahu, ki prenašajo moške spolne celice v ženske spolne celice.
Spolno razmnoževanje se med različnimi skupinami rastlin dogaja na različne načine. Za dokončanje oploditve morajo moške spolne celice doseči ženske. Zooidogamija in sifonogamija sta dva načina, ki pojasnjujeta, kako moške spolne celice potujejo proti ženskim spolnim celicam. V zooidogamiji moške spolne celice plavajo proti ženskim, medtem ko v sifonogamiji moške spolne celice potujejo skozi cvetni prah proti ženskim spolnim celicam. Na primer, alge, briofiti, pteridofiti in nekatere golosemenke kažejo zooidogamijo, medtem ko semenske rastline kažejo sifonogamijo.
