Ključna razlika med V-tipom in F-tipom ATPaze je, da V-tip ATPaza deluje kot ATP-ionska črpalka, medtem ko F-tip ATP-aza deluje kot ATP-sintaza v celicah.
ATPaza je izraz, ki se nanaša na encime, ki lahko hidrolizirajo ATP. Na splošno ATPaze razgradijo ATP in energija, ki se sprosti med reakcijo, se porabi za delo, saj je ATP valuta energije, ki zagotavlja energijo za večino vseh celičnih procesov. Razčlenitev ATP potrebuje ATPaze. Zato ATPaze znižujejo aktivacijsko energijo hidrolize ATP. Obstajajo štiri glavne vrste ATP-az, kot so F-ATPaze, V-ATPaze, A-ATPaze in P-ATPaze. ATP-aze tipa V najdemo predvsem v evkariontskih celičnih vakuolah. ATPaze tipa F pa najdemo v bakterijskih plazemskih membranah, notranji membrani mitohondrijev in kloroplastih. Katalizirajo hidrolizo ali sintezo spajanja ATP s prenosom H + (ali Na +) skozi membrano.
