Ključna razlika med metodo difuzije v agarju in diskom je v tem, da se pri metodi difuzije v agarju raztopina ekstrakta napolni v luknjo ali vdolbino, ustvarjeno na agarskem mediju, medtem ko je pri metodi difuzije agar-diska disk iz filtrirnega papirja, ki vsebuje na površino agarja.
Mikroorganizmi so povzročitelji številnih bolezni. Obstajajo različna protimikrobna sredstva, ki uničujejo mikroorganizme in zavirajo ali zadržujejo njihovo rast. Na voljo so različne metode presejanja in ocenjevanja za odkrivanje protimikrobne aktivnosti. Med njimi so metode difuzije agarnih vrtin in metode difuzije agarnih diskov najpogosteje uporabljene metode in vitro analize, ki so metode difuzije agarja. Te metode se pogosto uporabljajo, ker ne zahtevajo posebne opreme in nadaljnje ocene obnovljivosti in standardizacije. Obe metodi sta odvisni od difuzije protimikrobnega sredstva skozi agarski medij.
