Ključna razlika med DMSO in MSM je v tem, da je DMSO organsko žveplova spojina, ki obstaja v tekoči fazi, MSM pa je organsko žveplova spojina, ki obstaja v trdni fazi.
Izraz DMSO pomeni dimetil sulfoksid, medtem ko izraz MSM pomeni metilsulfonilmetan. Oba sta organsko žveplovi spojini. To pomeni; te spojine imajo žveplove atome, vezane na organske spojine. Glavna razlika med DMSO in MSM je v fazi snovi, v kateri te spojine obstajajo pri sobni temperaturi. Poleg te ključne razlike obstajajo tudi nekatere druge razlike.