Ključna razlika med homozigotnimi in heterozigotnimi je v tem, da homozigotni pomeni, da sta si alela podobna za neko lastnost, medtem ko heterozigotna pomeni, da sta si alela za neko lastnost različna.
Geni, podedovani po starševskih kromosomih, nadzorujejo vse znake ali lastnosti živali, rastlin in vseh drugih živih bitij. To je glavni razlog za prikaz starševskih lastnosti v potomstvu. Večina evkariontskih organizmov ima dva sklopa genov, znanih kot materinski geni in očetovski geni. Zato je genetska situacija znana kot diploid (dva sklopa kromosomov). To pomeni; vse lastnosti imajo genetske komponente tako matere kot očeta. Ti geni pa bi lahko bili med seboj prevladujoči ali recesivni, zato postanejo pomembne homozigotne in heterozigotne značilnosti. Homozigotno je stanje dveh dominantnih alelov (AA) ali dveh recesivnih alelov (aa), medtem ko je heterozigotno stanje enega dominantnega alela in enega recesivnega alela (Aa).
