Ključna razlika med pepsinom in reninom je v tem, da je pepsin, ki je eden glavnih prebavnih encimov, proteaza, ki jo izloča želodec, medtem ko je renin encim in tudi hormon, ki ga proizvajajo jukstaglomerularne ledvične celice.
Proteaze so encimi, ki hidrolizirajo peptidne vezi in razgradijo beljakovine v peptide ali aminokisline. Pepsin je proteaza, ki je prisotna v želodčnem soku. Je eden glavnih prebavnih encimov, ki beljakovinsko hrano razgradi v peptide in aminokisline. Nasprotno pa je renin encim in asparaginska proteaza. Je pobudni encim sistema renin-angiotenzin. Renin deluje kot hormon in pomaga nadzorovati krvni tlak.