Ključna razlika med pobratenjem umetnih zarodkov in jedrskim prenosom somatskih celic je v tem, da je umetno pobraščanje zarodkov tehnika, pri kateri poteka razdelitev oplojenega jajčeca na dva genetsko enaka zarodka v pogojih in vitro, medtem ko je prenos jedra somatskih celic tehnika, pri kateri je vstavitev jedro somatske celice v enukleirano jajčno celico poteka v pogojih in vitro.
Molekularno kloniranje je pomembna tehnika za tvorbo rekombinantnih organizmov z izboljšanimi lastnostmi. Umetno pobratenje zarodkov in jedrski prenos somatskih celic sta dve takšni tehniki, ki se uporabljata v pogojih in vitro za ustvarjanje klonov tako za reproduktivne kot terapevtske namene. Vendar obstaja razlika med umetnim pobratenjem zarodkov in jedrskim prenosom somatskih celic v smislu njihove metode kloniranja.
