Ključna razlika med skupnim številom celic in številom vitalnih celic je, da skupno število celic oceni vse celice, vključno z živimi in odmrlimi mikrobnimi celicami v vzorcu, medtem ko število vitalnih celic oceni samo žive mikrobne celice v vzorcu.
Štetje števila organizmov znotraj populacije se šteje za nujno za večino eksperimentalnih del. Zato poskušamo analizirati število mikrobov v vzorcu z neposrednimi in posrednimi metodami. Neposredne meritve vključujejo metode, ki štejejo število celic neposredno. Posredne meritve vključujejo merjenje nekaterih parametrov, ki so lahko povezani s številom celic, kot so gostota celic, suha teža itd. Nekatere metode količinsko opredelijo le žive mikrobne celice v vzorcu. Število preživelih celic je ena takih metod. Neposredno mikroskopsko štetje z mikroskopom kvantificira vse celice v znanem volumnu gojišča / vzorca. Zato šteje tako žive kot mrtve celice. To je vrsta skupnega števila celic.
