Ključna razlika med mezenhimskimi in hematopoetskimi matičnimi celicami je v tem, da se mezenhimske matične celice lahko diferencirajo v nevrone, kosti, hrustanec, mišice in maščobne celice, medtem ko se hematopoetske matične celice lahko diferencirajo v vse vrste krvnih celic v našem telesu.
Matične celice so nediferencirane ali nespecializirane celice, ki so prisotne v našem telesu. Lahko se delijo in dajejo isto vrsto matičnih celic ali se diferencirajo v specializirane celice v tkivih, ki imajo določene funkcije. Zaradi teh izjemnih sposobnosti matičnih celic se uporabljajo pri obnavljanju in obnavljanju poškodovanih tkiv. Mezenhimske matične celice in hematopoetske matične celice sta dve vrsti matičnih celic, ki sta izjemno pomembni. Mezenhimske izvorne celice (nehematopoetske matične celice) so multipotentne matične celice, ki lahko tvorijo kostne, hrustančne in maščobne celice. Po drugi strani pa lahko hematopoetske matične celice v telesu tvorijo vse vrste krvnih celic. Poleg tega sta obe vrsti matičnih celic prisotni v kostnem mozgu.
