Ključna razlika med klorofilom A in B je, da je klorofil A primarni fotosintetski pigment v rastlinah in algah, medtem ko je klorofil B dodatni pigment, ki zbira energijo in prehaja v klorofil A.
Klorofil je družina naravnih pigmentov, ki so prisotni v rastlinah in algah in je odgovoren za njihovo zeleno barvo. Klorofil absorbira energijo sončne svetlobe in jo izkoristi za sintezo ogljikovih hidratov iz vode in ogljikovega dioksida. Postopek, imenovan fotosinteza, je tisti, ki vzdržuje življenjske procese v vseh rastlinah, saj se s tem postopkom izpolnjujejo njihove energetske potrebe. Poleg tega je fotosinteza glavni proces, ki vzdržuje vse žive organizme, saj so rastline glavni proizvajalci vseh prehranjevalnih verig. Živali in ljudje uživajo rastlinske proizvode. V družini klorofilnih pigmentov obstaja več vrst pigmentov klorofila. Med njimi sta klorofil A in klorofil B dve vrsti klorofilov. Imajo podobno strukturo z majhno razliko v porfirinskem obroču. Klorofil A ima CH3 skupine v porfirinskem obroču, medtem ko ima klorofil B CHO (aldehidna skupina) v porfirinskem obroču.
