Ključna razlika med mutacijo zarodnih linij in somatsko mutacijo je v tem, da mutacija zarodne linije podeduje potomce, medtem ko somatska mutacija potomcem ni neločljiva.
DNA je dedna snov večine živih organizmov. Mutacija je trajna sprememba nukleotidnega zaporedja fragmenta DNA ali gena. V živih organizmih se pojavljajo različne vrste mutacij. Med njimi sta somatski mutaciji in mutaciji zarodnih linij dve glavni vrsti. Somatske mutacije se pojavijo v posameznih telesnih celicah, mutacije zarodnih linij pa v spolnih celicah. Kadar somatska mutacija poteka v posamezni celici telesa, vpliva samo na tkivo, ki izhaja iz mutirane celice. V nasprotju s tem vse telesne celice vplivajo na to, kdaj pride do mutacije zarodnih linij. Glavna razlika med mutacijo zarodnih linij in somatsko mutacijo je možnost, da te mutacije preidejo v potomce ali ne.