Ključna razlika med glukogenimi in ketogenimi aminokislinami je v tem, da glukogene aminokisline med katabolizmom proizvajajo piruvat ali katere koli druge predhodnike glukoze, medtem ko ketogene aminokisline med katabolizmom proizvajajo acetil CoA in acetoacetil CoA.
Aminokisline so temeljne molekule, ki tvorijo kemično strukturo beljakovin in polipeptidov. Čeprav obstajajo različne klasifikacije aminokislin, jih lahko uvrstimo med glukogene in ketogene aminokisline, odvisno od intermediatov, ki jih tvorijo med katabolizmom. Kot smo že omenili, končni produkt katabolizma aminokislin daje dve vrsti vmesnih produktov; bodisi piruvat (ali drugim predhodnikom glukoze) bodisi acetil CoA in acetoacetil CoA.
