Ključna razlika med komplementarnimi in dopolnilnimi geni je v tem, da komplementarni geni zahtevajo prisotnost vsakega gena pri izražanju lastnosti, medtem ko le en gen od dveh dopolnilnih genov pri izražanju lastnosti zahteva prisotnost drugega gena.
Geni medsebojno sodelujejo pri ustvarjanju lastnosti pri posamezniku. Te interakcije so zapletene in jih je treba poglobiti, da bi razumeli, kako delujejo skupaj in kako prisotnost genov vpliva na izražanje lastnosti. Komplementarni in dopolnilni geni sta dve takšni vrsti genov, ki medsebojno sodelujejo pri ustvarjanju lastnosti. Prikazujejo epistatične genske interakcije, kar pomeni, da je učinek enega gena odvisen od prisotnosti drugega gena.
