Ključna razlika - VNTR proti STR
Študije DNK imajo izjemno korist pri razumevanju in določanju filogenetskih razmerij, diagnosticiranju genskih bolezni in kartiranju genoma organizma. Za identifikacijo določenega gena ali zaporedja DNA v skupini neznanih DNA se uporablja več tehnik, povezanih z analizo DNA. Znani so kot genetski označevalci. Genetski markerji se v molekularni biologiji uporabljajo za ugotavljanje genskih razlik med posamezniki in vrstami. Tandemska ponovitev spremenljivega števila (VNTR) in kratka ponovitev tandema (STR) sta dve vrsti genetskih markerjev, ki kažeta polimorfizem med posamezniki. Obe vrsti sta nekodirajoči ponavljajoči se DNA, ki sta tandemski ponovitvi. V kromosomih so razporejeni na enak način. VNTR je del genoma, kjer se večkrat ponovi kratko zaporedje nukleotidov. STR je še en odsek DNA znotraj genoma, ki je organiziran kot ponavljajoče se enote, sestavljene iz dveh do trinajstih nukleotidov v stokrat. Ključna razlika med VNTR in STR je število nukleotidov v ponavljajočem se zaporedju. Ponavljajoče se enote VNTR sestavljajo od 10 do 100 nukleotidov, ponavljajoče enote STR pa od 2 do 13 nukleotidov. VNTR in STR se pogosto uporabljajo v forenzičnih študijah.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj je VNTR
3. Kaj je STR
4. Podobnosti med VNTR in STR
5. Vzporedna primerjava - VNTR proti STR v tabelarni obliki
6. Povzetek
Kaj je VNTR?
Tandemska ponovitev je kratko zaporedje DNA, ki se ponovi od glave do repa na določenem kromosomskem lokusu. V ponovitvi tandema ni drugega zaporedja ali nukleotida. V genomu je več vrst tandemskih ponovitev. VNTR je vrsta tandemskih ponovitev med njimi, ki ima ponavljajoče se enote, sestavljene iz 10 do 100 nukleotidov. VNTR je vrsta mini satelita. Te tandemske ponovitve najdemo v številnih kromosomih. Premešani so znotraj človeškega genoma in se nahajajo pretežno v subtelomernih predelih kromosomov.
VNTR kažejo polimorfizem tandemskega ponavljanja med posamezniki. Dolžina VNTR na določenem mestu kromosoma je med posamezniki zelo različna zaradi različnega števila ponavljajočih se enot, organiziranih v tem odseku DNA. Zato se VNTR lahko uporablja kot močno orodje za identifikacijo posameznikov, analiza VNTR pa se uporablja na številnih področjih, vključno z genetiko, biološkimi raziskavami, forenziko in DNK odtisom prstov. VNTR so bili prvi genetski markerji, ki so se uporabljali za kvantificiranje presaditve presaditve kostnega mozga. VNTR so bili tudi prvi polimorfni markerji, ki se uporabljajo pri profiliranju DNK v forenziki.
Slika 01: Razlike VNTR pri šestih posameznikih
Analiza VNTR se opravi s polimorfizmom dolžine restrikcijskih fragmentov, čemur sledi hibridizacija na jugu. Zato potrebuje razmeroma velik vzorec DNA. Problematična je tudi razlaga profila VNTR. Zaradi teh omejitev je bila uporaba VNTR v forenzični genetiki omejena in jo je nadomestila analiza STR.
Kaj je STR?
STR je zelo ponavljajoč se odsek DNA, ki ga sestavljajo dve do trinajst enot, ki ponavljajo nukleotide, organizirane na tandem. STR je podoben VNTR. Toda razlikuje se od VNTR od števila nukleotidov v ponavljajočem se zaporedju in števila ponovitev. STR je vrsta mikrosatelita.
Analiza STR vključena v merjenje natančnega števila ponavljajočih se enot. STR so zelo različni med posamezniki, podobno kot VNT. STR profili se razlikujejo od osebe do osebe. Zato se STR analiza v molekularni biologiji uporablja za primerjavo specifičnih lokusov na DNA iz dveh ali več vzorcev. Zato se STR v molekularni biologiji štejejo za močne genetske označevalce. Zagotavlja odlično orodje za identifikacijo posameznikov zaradi visoke stopnje polimorfizma in razmeroma kratke dolžine.
Trenutno so STR najpogosteje uporabljeno analizirano orodje za genski polimorfizem v forenzični genetiki. Večina forenzičnih primerov vključuje polimorfno analizo STR. Lokusi STR so razširjeni po celotnem genomu. V kromosomih je na tisoče STR, ki jih je mogoče uporabiti pri forenzični analizi. Analiza STR ne vključuje polimorfizma omejitvene dolžine, kot je analiza VNTR. STR analiza ne reže DNA z restrikcijskimi encimi. Za pritrditev želenih regij na DNA se uporabljajo posebne sonde in s pomočjo tehnike PCR se določijo dolžine STR.
Slika 02: STR variacije med vzorci
Kakšne so podobnosti med VNTR in STR?
- VNTR in STR sta nekodirajoča DNA.
- Oba sta tandemska ponavljanja.
- Oba kažeta polimorfizem med posamezniki zaradi razlike v dolžini odseka DNK.
- Oba se uporabljata kot močna genetska označevalca pri odtisuvanju prstov z DNK in v forenzičnih študijah.
Kakšna je razlika med VNTR in STR?
Diff Article Sredina pred mizo
VNTR proti STR |
|
| VNTR je nekodirajoča ponavljajoča se DNA, ki ima kratko zaporedje nukleotidov, ponovljeno v tandemu. | STR je zelo ponavljajoč se odsek DNA, ki ga sestavljajo dve do trinajst enot, ki ponavljajo nukleotide, organizirane na tandem. |
| Velikost | |
| VNTR so večji od STR. | STR so manjši od VNTR. |
| Število nukleotidov v ponavljajočem se zaporedju | |
| Ponavljajoča se enota VNTR je sestavljena iz 10 do 100 nukleotidov. | Ponavljajoča se enota STR je sestavljena iz 2 do 13 nukleotidov. |
Povzetek - VNTR vs STR
VNTR in STR sta dva močna genetska označevalca, ki se uporabljata v molekularni biologiji, zlasti na področju forenzične genetike. VNTR je vrsta mini satelita, STR pa mikrosatelit. VNTR in STR sta nekodirajoča, zelo ponavljajoča se DNA. So tandemske ponovitve. Splošna struktura VNTR in STR sta enaki. Vendar sta število nukleotidov v ponavljajočem se zaporedju in dolžina različna. VNTR ima ponavljajoča se zaporedja, sestavljena iz 10 do 100 nukleotidov. STR ima ponavljajoča se zaporedja, sestavljena iz 2 do 13 nukleotidov. To je razlika med VNTR in STR.
Prenesite PDF različico VNTR vs STR
Lahko prenesete različico tega članka v obliki PDF in jo uporabite za namene brez povezave v skladu z opombami k navedbam. Prenesite različico PDF tukaj Razlika med VNTR in STR.
