Ključna razlika - Probe vs Primer
Molekularna sonda je majhen fragment DNA ali RNA, ki prepozna komplementarna zaporedja v DNA ali RNA in omogoča identifikacijo ciljnega zaporedja. Primer je majhen odsek DNA ali RNA, ki služi kot izhodišče za sintezo DNA. Primeri in sonde se hibridizirajo z komplementarnimi nukleotidi vzorčne DNA ali ciljne DNA. Ključna razlika med sondo in primerjem pa je, da so primerji potrebni za replikacijo DNA, medtem ko so sonde potrebne za odkrivanje določenih sekvenc v vzorčni DNA.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj je sonda
3. Kaj je primer
4. Vzporedna primerjava - sonda vs primer
5. Povzetek
Kaj je sonda?
Sonda je majhen fragment DNA ali RNA, ki se uporablja za odkrivanje ciljne DNA ali RNA v vzorcu z molekularno hibridizacijo. Znani so tudi kot molekularni markerji. Dolžina sonde se lahko spreminja (od 100 do 1000 baz), nukleotidi sonde pa dopolnjujejo del ciljne sekvence. Za lažje odkrivanje so sonde označene z radioaktivnimi izotopi ali s fluorescentnimi barvili ali protitelesi. Sonde se vežejo na komplementarne baze ciljnega zaporedja in razkrijejo prisotnost ciljne DNA ali RNA v vzorcu. Obstajata dva glavna načina označevanja sond: označevanje na koncu in prevajanje vzdevkov. Sonde so razvrščene v različne tipe, vključno z DNK sondami, RNA sondami, cDNa sondami in sintetičnimi oligonukleotidnimi sondami ter so pripravljene z različnimi tehnikami.
Sonde so pomembno orodje na številnih mikrobnih in molekularnih področjih, kot so virologija, forenzična patologija, testiranje očetovstva, odvzem prstnih odtisov DNK, odkrivanje genskih bolezni, RFLP, molekularna citogenetika, hibridizacija in situ itd.
Slika 01: Fluorescentno označena sonda, ki se uporablja v FISH za odkrivanje patogenov
Kaj je Primer?
Primer je kratek fragment DNA ali RNA, ki služi kot pobudnik za sintezo DNA. Encim DNA polimeraza doda nukleotide v 3 'OH skupino začetnih zaporedij in sintetizira novo verigo, ki je komplementarna vzorčni DNA. Primeri so zelo kratki fragmenti z dolžino 18 do 20 nukleotidov. Kemično jih sintetizirajo v laboratoriju za in vitro ojačitev DNA (PCR). Primeri imajo lahko poljubno zaporedje nukleotidov, saj jih je oblikoval uporabnik. Sintetizirajo se tako, da se ujemajo z komplementarnimi bazami DNA vzorca. Zato ima lahko katero koli zaporedje nukleotidov. Primeri so izjemnega pomena za replikacijo DNA, saj DNA polimeraza ne more sintetizirati nove DNA brez predhodno obstoječega kosa DNA. Pri oblikovanju primerjev za PCR je treba upoštevati naslednje stvari:
- Primeri bi morali vsebovati komplementarne nukleotide do bočnega konca DNA, ki se želi ojačati.
- Temeljni premazi naj imajo temperaturo tališča med 55 - 65 0 C
- Vsebnost G in C naj bo med 50 in 60%.
V PCR se dva primerja uporabljata kot naprej in nazaj, da se ponovita obe verigi vzorčne DNA. Primerji se običajno uporabljajo za izvajanje zaporedja PCR in DNA.
Slika 02: Žarjenje primerja v PCR
Kakšna je razlika med Probe in Primer?
Diff Article Sredina pred mizo
Probe vs Primer |
|
| Sonda je majhen fragment DNA / RNA, ki se uporablja za odkrivanje prisotnosti ciljnega zaporedja v vzorcu z molekularno hibridizacijo. | Primer je majhen del DNA ali RNA, ki služi kot izhodišče za replikacijo DNA. |
| Funkcija | |
| Ta zazna prisotnost določenega zaporedja v vzorcu DNA ali RNA. | To je izhodišče za sintezo DNA. |
| Dolžina | |
| Dolžina je lahko med 100 in 1000 bazami | Dolžina je običajno približno 18 - 20 baz |
| Vezava s komplementarnim zaporedjem | |
| Sonda hibridizira z komplementarnimi bazami ciljnega zaporedja | Primerne žarilke z komplementarnimi osnovami verig DNA. |
| Označevanje | |
| Sonde so označene za lažje odkrivanje | Primerji na splošno niso označeni |
| Uporaba v PCR | |
| Sonde se pri PCR ne uporabljajo | Primeri se uporabljajo pri PCR |
Povzetek - Probe vs Primer
Sonda je majhen fragment zaporedja DNA ali RNA, ki ga je mogoče hibridizirati s komplementarnimi nukleotidi za odkrivanje ciljnega zaporedja v vzorcu. Sonde so označene radioaktivno, imunološko ali fluorescentno, da se ugotovi prisotnost ciljne sekvence. Primer je zelo majhen fragment DNA ali RNA, ki deluje kot izhodišče za in vitro ojačitev DNA. DNA polimeraza identificira primer 3 'OH skupine in začne graditi novo verigo, ki dopolnjuje predlogo. Sonde in primerji delujejo podobno s hibridizacijo z komplementarnimi nukleotidi. Ključna razlika med sondo in temeljnim premazom je njihova glavna funkcija.
