Ključna razlika med radioaktivnimi in neradioaktivnimi sondami je v tem, da so radioaktivne sonde enoverižne sekvence DNA ali RNA, ki so označene z radioaktivnimi izotopi, medtem ko so neradioaktivne sonde enoverižne sekvence DNA ali RNA, ki so označene s kemično ali fluorescentno oznako.
Hibridizacija nukleinske kisline je pomembna tehnika v molekularni biologiji, zlasti pri mikrobni diagnostiki. Pomaga prepoznati ali odkriti določeno zaporedje nukleinske kisline. V tej tehniki se nukleinske kisline pritrdijo na trdno površino in hibridizirajo s sondo. Sonda je fragment DNA ali RNA, ki dopolnjuje zaporedje, ki nas zanima. Če je v vzorcu prisotno ciljno zaporedje, se sonda hibridizira z njo in jo omogoči zaznavno. Obstajata dve vrsti sond, kot so radioaktivne in neradioaktivne sonde. Zato lahko sonde označimo z radioaktivno ali fluorescentno oznako.