Ključna razlika med RP HPLC in HIC je, da RP HPLC uporablja bolj polarno mobilno fazo in manj polarno stacionarno fazo. Medtem ko HIC uporablja hidrofobno stacionarno fazo, ki omogoča hidrofobnim molekulam, da se pritrdijo nanjo.
Kromatografija je analitična tehnika, ki pomaga ločevati mešanico na njene sestavne dele. Najprej moramo raztopiti vzorec, da se loči v raztopino. Ta zmes raztopine in snovi se imenuje mobilna faza. Nato se mobilna faza prenese skozi drug material, imenovan stacionarna faza. Stacionarna faza določa ločitev komponent. Do ločitve pride zaradi razdelitve materiala med mobilno fazo in stacionarno fazo.
