Ključna razlika med F plazmidom in R plazmidom je, da je F plazmid ekstrakromosomska DNA, ki vsebuje gene, ki kodirajo faktor plodnosti. Medtem je R plazmid ekstrakromosomska DNA, ki vsebuje gene, ki kodirajo odpornost proti antibiotikom.
Plazmid je majhna krožna dvoverižna DNA, prisotna v bakterijah. So ekstrakromosomska DNK in se lahko samopodvaja. Nosijo gene, potrebne za njihovo samokopiranje in vzdrževanje. Poleg tega, da vsebujejo gene, ki so potrebni za samopodvajanje, plazmidi vsebujejo tudi več drugih genov, ki so potrebni za kodiranje posebnih lastnosti, kot so odpornost na antibiotike, razgradnja makromolekul, toleranca za težke kovine, tvorba bakteriocinov, prenos genov itd. koristno za bakterije.
Poleg tega obstaja veliko različnih plazmidov. R plazmidi in F plazmidi so med njimi dve vrsti. F plazmid je plazmid za plodnost, ki je sposoben konjugacije in tvorbe spolnih pilijev. R plazmid je odporni plazmid, ki je sposoben zagotoviti odpornost proti antibiotikom in nekaterim zaviralcem rasti bakterij.
