Ključna razlika med avtologno in alogensko presaditvijo matičnih celic je v tem, da se pri avtologni presaditvi izvornih celic pri presaditvi uporabljajo lastne celice, pri alogenski presaditvi matičnih celic pa se darovalec pred presaditvijo uskladi in nato aplicira.
Presaditev matičnih celic je tehnika, ki se večinoma uporablja pri zdravljenju raka. Pri presaditvi izvornih celic se matične celice dajo z ustreznimi naprednimi lastnostmi, tako da se razvijejo v imunološke celice, ki lahko uničijo rakave celice. Njegova druga naloga je zaščititi nemaligne celice v telesu. Avtologna in alogena presaditev matičnih celic sta dve vrsti tehnik presaditve matičnih celic. Avtologna presaditev izvornih celic uporablja lastne izvorne celice za presaditev, medtem ko alogena presaditev izvornih celic uporablja matične celice ujemajočega se darovalca.
