Ključna razlika med dekantacijo in filtracijo je v tem, da dekantacija loči dve komponenti v zmesi tako, da odlije eno komponento, medtem ko filtracija loči dve komponenti s filtriranjem ene komponente.
Dekantacija in filtracija ločujeta dve komponenti v mešanici tekočina-trdna snov ali mešanici dveh tekočin, ki se ne mešata, pod silo gravitacije. Za filtracijo pa se za to ločevanje uporablja filtrirni papir ali drug ustrezen filter. Dekantacija pa je samo odlivanje tekočine, da se izolira trdna snov ali druga tekočina v zmesi. Zato je filtracija izmed obeh najbolj natančna metoda, v nekaterih primerih pa je uporabna tudi dekantacija.
