Ključna razlika med ionskim parom in ionsko izmenjevalno kromatografijo je v tem, da je pri ionski parni kromatografiji mogoče ione v vzorcu "seznaniti" in ločiti kot ionski par, medtem ko lahko pri ionsko izmenjalni kromatografiji ione v vzorcu ločimo kot kation anione ločeno.
Kromatografija je pomembna tehnika, ki vodi do ločevanja različnih komponent v zmesi. Kromatografija z ionskim parom in ionsko izmenjavo sta analitični tehniki, ki ju lahko uporabimo za ločevanje ionov in polarnih molekul v zmesi na podlagi električnega naboja, ki ga nosijo s seboj.