Ključna razlika med knock in in knockout je odvisna od metode, ki se uporablja za ustvarjanje transgenega organizma. Pri udarcu gena pride do vstavitve novega gena, medtem ko pri izločitvi gena pride do odstranitve obstoječega gena, da se ustvari transgeni organizem.
Transgeni organizmi so organizmi s spremenjeno genetsko strukturo. „Rekombinantni organizmi“je sinonim zanje. V večini primerov imajo transgeni organizmi koristne lastnosti. Pri ustvarjanju transgenih organizmov postanejo geni tarča. Glede na potrebe je gen mogoče vnesti ali odstraniti. Genski knock in se nanaša na uvedbo novega gena, medtem ko se genski knockout nanaša na odstranitev gena.
