Ključna razlika med kariotipom in idiogramom je v tem, da je kariotip dejanska slika celotnih kromosomov celice, medtem ko je idiogram shematski diagram kariotipa, ki ponazarja vse kromosomske karte.
Komplet kromosomov predstavlja genom in genetske informacije organizma. Vsak kromosom ima edinstveno obliko, velikost in nabor genov. Število in fizične strukture kromosomov razkrivajo pomembne informacije o organizmu. Kariotipizacija je tehnika, ki se izvaja za pregled celotnega nabora kromosomov v celici. Med tem testom se zberejo in analizirajo celotni kromosomi, da se ugotovi, ali obstajajo številčne ali strukturne nepravilnosti v kromosomih. Dejanska slika celotnih kromosomov celice je kariotip, shematski diagram celotnih kromosomov celice pa idiogram. Oboje je pomembno pri citogenetskih študijah.
