Ključna razlika med mehkužci in iglokožci je odvisna od habitata organizmov iz teh dveh razredov. Mehkužci živijo tako v kopenskem kot v vodnem okolju, iglokožci pa strogo v morskem okolju.
Phylum Mollusca in Phylum Echinodermata pripadata kraljevini Animalia. Med mehkužci in iglokožci obstaja med seboj morfološke, fiziološke in vedenjske značilnosti. Tako mehkužci kot iglokožci so triploblastični in imajo popoln prebavni sistem. Biologi in taksonomisti preučujejo značilnosti organizmov vsakega tipa, da lahko organizme učinkovito razvrstijo.