Ključna razlika med bazo in nukleofilom je, da so baze akceptorji vodika, ki lahko izvajajo nevtralizirajoče reakcije, medtem ko nukleofili napadajo elektrofile, da sprožijo nekatere organske reakcije.
Kisline in baze so dva pomembna pojma v kemiji. Oba imata nasprotujoče si lastnosti. Nukleofil je izraz, ki ga v organski kemiji bolj izrazito uporabljamo za opisovanje reakcijskih mehanizmov in hitrosti. Strukturno ni nobene razlike med bazo in nukleofilom, vendar funkcionalno opravljajo različne naloge.