Ključna razlika med alelom in lokusom je, da se alel nanaša na eno od dveh ali več alternativnih zaporedij gena na določenem lokusu, medtem ko se lokus nanaša na določeno lokacijo v kromosomu, kjer je gen mogoče najti.
V obliki genov genetske informacije podedujejo od staršev do potomcev. Geni so specifična nukleotidna zaporedja, ki se nahajajo v kromosomih. V genomu organizma je mogoče najti veliko genov. Njihova razporeditev v genomu je natančna, lokacijo gena pa je enostavno najti z uporabo genskega markerja. Poleg tega ima lahko določen gen različne različice, ki jih imenujemo aleli. Zelo pomembna je tudi specifična lokacija gena v kromosomu in mu pravimo lokus.
