Ključna razlika med geografsko in reproduktivno izolacijo je, da je geografska izolacija kategorija reproduktivne izolacije, ki se nanaša na ločevanje populacij organizmov od parjenja ali izmenjave njihovega genskega materiala s fizičnimi mejami, medtem ko se reproduktivna izolacija nanaša na niz mehanizmov, ki preprečujejo vrstam pred parjenjem in rojevanjem plodnih potomcev.
Oploditev je združitev sperme in jajčeca, da med spolnim razmnoževanjem tvori diploidno zigoto. Če je proizvedena zigota zrela, bo sčasoma prerasla v zdravo plodno potomstvo. zato je reproduktivna izolacija postopek, ki preprečuje nastanek plodnega potomstva. To preprečevanje se lahko zgodi med postopkom oploditve ali po oploditvi. Kakor koli, na koncu ustvari oviro za proizvodnjo plodnega potomstva, ki lahko rodi drugo plodno potomstvo. Med različnimi mehanizmi je geografska izolacija dejavnik reproduktivne izolacije.
