Ključna razlika med Iso in Sec v organski kemiji je, da z izrazom iso poimenujemo organsko spojino, ki vsebuje vse atome ogljika, razen enega, ki tvori neprekinjeno verigo, medtem ko z izrazom sec označujemo funkcionalno skupino, ki je vezana na sekundarni ogljik atom.
V organski kemiji je veliko predpon, s katerimi identificiramo skupine, ki so prisotne v spojinah, in poimenujemo organske molekule, da jih ločimo med seboj. Poleg tega lahko boljši nomenklaturni sistem imenuje celo zelo zapleteno molekulo. Na primer: IUPAC nomenklatura je najboljši nomenklaturni sistem, ki poda vse podrobnosti o strukturi kemične spojine.
