Ključna razlika med genetsko karto in fizično karto je v tehnikah, ki se uporabljajo pri kartiranju genoma. Pri ustvarjanju genetskega zemljevida se za preučevanje vzorcev genske povezave uporabljajo genetski označevalci in genetski lokusi, medtem ko fizično kartiranje uporablja tehnike molekularne biologije, kot sta polimorfizem dolžine omejenega fragmenta (RFLP) in hibridizacija.
Genetski zemljevidi in fizični zemljevidi dve vrsti zemljevidov, ki sestavljajo gene, ki se nahajajo v kromosomih. Vključujejo genetsko diagnostiko in napovedujejo razvoj analize genoma. Poleg tega uporabljajo za analizo razdalje med genskimi lokusi in za analizo genskih polimorfizmov.
