Ključna razlika - Genotipizacija proti zaporedju
Genotipizacija in zaporedje sta dve tehniki, ki se izvajata za pridobivanje informacij o nukleinskih kislinah, predvsem DNK organizma. Ključna razlika med genotipizacijo in sekvenciranjem je v tem, da je genotipizacija postopek določanja genetske variante posameznika z uporabo markerjev, sekvenciranje pa je določitev pravilnega vrstnega reda nukleotidnega zaporedja znotraj danega fragmenta DNA.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj je genotipizacija
3. Kaj je sekvenciranje
4. Vzporedna primerjava - Genotipizacija in sekvenciranje
5. Povzetek
Kaj je genotipizacija?
Genotipizacija je določitev genetske sestave posameznika z uporabo zaporedja DNA in markerjev ter primerjava in identifikacija njegove dediščine. Genotipizacija je pomembna v evolucijski biologiji, populacijski biologiji, taksonomiji, ekologiji in genetiki organizmov. Izvaja se lahko z različnimi tehnikami, vključno z zaporedjem DNA, verižno reakcijo polimeraze, polimorfizmom dolžine restrikcijskih fragmentov (RFLP), naključno ojačano polimorfno detekcijo, polimorfizmom ojačane dolžine fragmentov (AFLP), mikromrežami DNA itd.
Genotipizacija vključuje zaporedje določenih majhnih fragmentov zaporedij DNA in ugotavljanje sorodnosti genske sestave z drugimi posamezniki z uporabo genskih markerjev. Določa posamezne nukleotidne polimorfizme (SNP) med posamezniki ali specifičnimi aleli. Genotipizacija se uporablja za širok spekter organizmov, vključno z ljudmi. Uporablja se tudi za mikroorganizme, kot so virusi, glive itd., Z referenčnimi profili pa se lahko določi njihove genetske različice. V molekularni epidemiologiji in sodni mikrobiologiji nadzor nad patogeni, zlasti mikroorganizmi, poteka z informacijami, pridobljenimi z genotipizacijo. Genotipizacija je pri analizi rodovnika zelo pomembna. Ljudje so genotipizirani za potrditev materinstva in očetovstva. Genotip bo razkril dominantne in recesivne alele genov, ki odločajo o posebnih lastnostih.
Slika_1: Genotipizacija RFLP
Kaj je zaporedje?
Sekvenciranje je postopek določanja pravilnega vrstnega reda nukleotida v danem fragmentu DNA ali RNA. Skoraj vse informacije, potrebne za rast in razvoj organizma, so kodirane v njegovem genomu. Razpoložljivost tehnik za proizvodnjo in ločevanje nekaj sto nukleotidov dolgih fragmentov nukleinskih kislin je privedla do razvoja postopkov določanja natančnega zaporedja nukleotidov danega fragmenta DNA ali RNA. Danes so na voljo različne vrste sekvenciranja. Te metode sekvenciranja, skupaj s tehnologijami za izdelavo knjižnic genoma, ki predstavljajo celoten genom organizma, olajšajo zaporedje celotnega genoma tega organizma, s poglobljeno analizo genskih struktur, funkcij genov, lokacij genov, izražanja genov kartiranje genov, gensko regulativne regije itd.
Skupni genomi številnih virusov, več bakterij, arhebakterij, kvasa in nekaterih drugih organizmov so bili sekvencirani in kartirani. Projekt človeškega genoma je omogočil zaporedje in preslikavo celotnega človeškega genoma in objavo njegovega prvega osnutka leta 2003. Je pomemben mejnik pri napredku biologije. Zaporedja človeškega genoma se zdaj uporabljajo v medicinskem sektorju za ugotavljanje genetskih vzrokov za redke bolezni, odkrivanje tveganja za bolezni novorojenčkov, prepoznavanje genetskih podrobnosti različnih vrst raka, razvoj novih terapevtikov in razvoj novih diagnostičnih orodij itd.
V rastlinskem svetu so sekvencirali genom riža in genom Arabidopsis. Poznavanje teh zaporedij bo nedvomno spremenilo naše razumevanje delovanja celic in organizmov.
Slika_2: Avtoradiograf zaporedja sangerjev
Kakšna je razlika med genotipizacijo in zaporedjem?
Diff Article Sredina pred mizo
Genotipizacija vs sekvenciranje |
|
| Genotipizacija je postopek določanja genske sestave posameznika in preverjanja skupine ali taksonomije tega organizma. | Sekvenciranje je postopek določanja natančnega vrstnega reda nukleotidov danega fragmenta DNA ali RNA. |
| Tehnike | |
| RFLP, zaporedje genov, PCR, mikromreže DNA, AFLP itd. | Sangerjevo zaporedje, Gilbertovo zaporedje, piro zaporedje, zaporedje naslednje generacije, zaporedje pušk itd. |
| Glavna vprašanja | |
| To je bolj zaskrbljeno, ali razlike v genotipu dajejo dejanske razlike v fenotipu. | To bolj skrbi vrstni red nukleotidov in njegove razlike ter spremembe z drugimi organizmi. |
Povzetek - Genotipizacija proti zaporedju
Genotipizacija in zaporedje sta koristna za preučevanje genskih informacij organizmov. Genotipizacija je postopek ugotavljanja variacij genotipov med posamezniki in iskanje njihovih kategorij. Sekvenciranje je postopek določanja pravilnega vrstnega reda nukleotidov v zainteresiranem fragmentu ali območju DNA. Obe tehniki dajeta pomembne informacije o genih in genomih.
