Ključna razlika med zaporedjem pušk in zaporedjem naslednje generacije je, da je zaporedje pušk metoda zaporedja, ki naključno razbije sekvence DNA na številne majhne fragmente in zaporedje sestavi z opazovanjem prekrivajočih se regij, medtem ko je zaporedje naslednjih generacij (NGS) napredna metoda gensko zaporedje, ki je odvisno od kapilarne elektroforeze.
Sekvenciranje je postopek, ki določa natančen vrstni red nukleotidov v genu, grozdu genov, kromosomu in celotnem genomu. V genomskih študijah, forenzičnih študijah, virologiji, biološki sistematiki, medicinski diagnostiki, biotehnologiji in na številnih drugih področjih je zelo pomembno analizirati strukturo in delovanje genov ter identifikacijo organizmov. Poleg tega so na voljo različne vrste metod zaporedja. Zaporedje pušk in zaporedje naslednje generacije sta med njimi dve napredni metodi.
