Ključna razlika med zaporedjem celotnega genoma in zaporedjem eksomov je v tem, da celotno zaporedje genoma zaporedi celoten genom organizma, medtem ko zaporedje zaporedja eksomov zaporedi samo eksome ali gene, ki kodirajo beljakovine organizma.
Sekvenciranje je tehnika, ki določa natančen vrstni red nukleotidov v določeni molekuli DNA. Odraža zgolj pravilen vrstni red štirih osnov; adenin (A), gvanin (G), citozin (C) in timin (T) v fragmentu DNA. Obstaja več metod zaporedja, kot so Sangerjevo zaporedje, zaporedje naslednje generacije itd. Poleg tega se lahko zaporedi celoten genom organizma (zaporedje celotnega genoma) ali samo geni, ki kodirajo beljakovine v genomu (zaporedje exome).
