Ključna razlika med tavtomerijo in metamerizmom je, da se tavtomerija nanaša na dinamično ravnovesje med dvema spojinama z isto molekulsko formulo, medtem ko se metamerizem nanaša na strukturno izomerijo, v kateri so različne alkilne skupine vezane na isto funkcionalno skupino.
Izomerija je obstoj kemičnih spojin z enako strukturno formulo, vendar različnimi prostorskimi ureditvami. Zato imajo izomeri enako število atomov v vsakem elementu, vendar je njihova razporeditev drugačna. Izomere lahko v glavnem razvrstimo v dve skupini kot strukturni izomeri in stereoizomeri. Tavtomerija in metamerizem sta dve podrazdelki strukturne izomerije.
