Ključna razlika med Krebsovim ciklom in glikolizo je v tem, da je Krebsov cikel, ki poteka v mitohondrijih, druga stopnja celičnega dihanja, medtem ko je glikoliza, ki poteka v citoplazmi, prva stopnja celičnega dihanja.
Krebsov cikel in glikoliza sta dve glavni fazi celičnega dihanja, ki v celicah proizvaja energijo. Oba procesa se pojavita na različnih celičnih lokacijah. Poleg tega uporabljajo različne encimske reakcije za pretvorbo različnih vhodnih snovi v različne izdelke. Poleg tega ta dva procesa ustvarjata različne količine ATP. Pri aerobnem dihanju Krebsov cikel sledi glikolizi. Toda pri anaerobnem dihanju glikoliza poteka sama.