Ključna razlika med endotelijem in mezotelijem je v tem, da je endotelij preprost ploščatocelični epitelijski celični sloj, ki obdaja celoten krvni obtok, vključno s krvnimi žilami, limfnimi žilami in srcem, medtem ko je mezotel preprost ploščatocelični epitelijski celični sloj, ki obloži glavne telesne votline, kot je npr. peritoneuma, plevre in perikarda.
Epitelij, mezotel in endotelij so tri vrste celičnih plasti, ki obdajajo naše notranje organe, telesne votline in kožo. Zato so vse zaščitne ovire telesa. Strukturno sta mezotel in endotelij specializirani ali spremenjeni epitelijski plasti z mezodermalnim poreklom. V skladu s tem so sestavljeni iz preprostih ploščatoceličnih epitelijskih celic. Tako mezotel kot endotelij sta enoslojna tkiva. Obložijo določene notranje površine.
