Ključna razlika med peptidom in dipeptidom je v tem, da je peptid kratka veriga aminokislin, ki se med seboj povezujejo s peptidnimi vezmi, medtem ko je dipeptid oblika peptida, ki ima bodisi dve aminokislini, povezani z enojno peptidno vezjo ali eno aminokislino z dve peptidni vezi.
Aminokisline so gradniki beljakovin. Zato tvorijo med seboj peptidne vezi, ki tvorijo kratke verige aminokislin; imenujemo jih »peptidi«. Dolge in neprekinjene peptidne verige so "polipeptidi". Te polipeptidne verige se med seboj povezujejo in tvorijo beljakovine. Izraz peptid je pogost izraz, ki ga uporabljamo za poimenovanje kratke verige aminokislin, izraz dipeptid pa je poseben izraz, s katerim poimenujemo določeno vrsto peptidov.