Ključna razlika med genskim materialom prokariontov in evkariontov je v tem, da genski material prokariontov plava v citoplazmi, ker nima jedra, medtem ko genski material evkariontov prebiva znotraj jedra. Druga pomembna razlika med tem je, da imajo prokarionti majhen genom in vsebujejo plazmide. Imajo tudi velik navit dvoveriran krožen kromosom, medtem ko imajo evkarionti večji genom in nimajo plazmidov.
Prokarionti in evkarionti so dve vrsti organizmov. Bakterije in arheje so prokarionti. Prokarionti imajo preprosto celično organizacijo. Nimajo jedra in pravih organelov. Po drugi strani imajo evkarionti zapleteno celično organizacijo z membransko vezanim jedrom in resničnimi organeli. Glive, protisti, rastline in živali so evkarionti.
