Ključna razlika - popravilo osnovne ekscizije v primerjavi z nukleotidnim ekscizijskim popravilom
DNA je pogosto izpostavljena poškodbam zaradi različnih notranjih in zunanjih dejavnikov. Vendar celični sistemi za popravilo takoj in nenehno odpravljajo poškodbe, preden postanejo mutacije ali preden se prenesejo v naslednje generacije. V celicah obstajajo trije tipi sistemov za obnovo ekscizije: popravilo nukleotidnih ekscizij (NER), popravilo baznega izreza (BER) in popravilo neusklajenosti DNA (MMR) za popravilo poškodb enojne DNA. Ključna razlika med popravilom izločanja baze in popravilom izločanja nukleotidov je v tem, da je popravilo izločanja osnov preprost sistem za popravilo, ki deluje v celicah za popravilo poškodb enojnih nukleotidov, povzročenih endogeno, medtem ko je popravilo izločanja nukleotidov kompleksen sistem za popravilo, ki deluje v celicah za primerjalno popravilo večje, poškodovane regije povzročene eksogeno.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj je popravilo ekscizije baze
3. Kaj je popravilo ekscizije nukleotida
4. Primerjava ob strani - popravilo baznega izreza v primerjavi z nukleotidnim ekscizijskim popravilom
5. Povzetek
Kaj je popravilo osnovnega izreza?
Popravilo osnovnega izreza je najpreprostejša različica sistema za popravilo DNA, ki ga imajo celice. Uporablja se za popravilo manjših poškodb DNK. Osnove DNA so spremenjene zaradi deaminiranja ali alkilacije. Ko pride do poškodb baze, DNA glikozilaza prepozna in aktivira sistem za obnovo ekscizije baze in ga obnovi s pomočjo encimov AP endonukleaze, DNA polimeraze in DNA ligaze. Sistem BER vključuje naslednje korake.
- Prepoznavanje in odstranjevanje nepravilne ali poškodovane baze z DNA glikozilazo, da se ustvari abasično mesto (mesta izgube baze - mesta apirurinskega ali apirimidinskega).
- Rez abasičnega mesta z apurinsko / apirimidinsko endonukleazo
- Odstranjevanje preostalega drobca sladkorja z lizo ali fosfodiesterazo
- Zapolnitev vrzeli z DNA polimerazo
- Tesnjenje zareze z DNA ligazo
Slika 01: Pot za popravilo osnovnega izreza
Kaj je Nucleotide Excision Repair?
Nucleotide Excision Repair (NER) je pomemben sistem za popravilo DNK v celicah. Lahko popravi in nadomesti poškodovane predele do 30 podstavkov, usmerja pa ga nepoškodovana šablona. Pogoste poškodbe DNK nastanejo zaradi ultravijoličnega sevanja in NER ščiti DNK tako, da te poškodbe odpravi tik preden postane mutacija in preide v prihodnje generacije ali povzroči bolezni. NER posebej zagotavlja zaščito pred mutacijami, ki jih posredno povzročajo eksogeni dejavniki, kot so okoljske in kemične rakotvorne snovi. NER je viden v skoraj vseh organizmih in prepozna poškodbe, ki povzročajo znatno izkrivljanje v vijačnici DNA.
Proces NER vključuje delovanje številnih beljakovin, kot so XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB itd., In poteka prek več rezalnih in paste podobnih mehanizmov. Te beljakovine so bistvenega pomena za zaključek postopka popravila, napaka enega od proteinov NER pa je življenjskega pomena in lahko povzroči redke recesivne sindrome: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayneov sindrom (CS) in fotoobčutljiva oblika krhke motnje las trihotiodistrofija (TTD).
Slika 02: Popravilo izločanja nukleotidov
Kakšna je razlika med popravilom osnovnega izreza in popravilom nukleotida?
Diff Article Sredina pred mizo
Popravilo osnovne ekscizije vs popravilo nukleotidne ekscizije |
|
| Popravilo osnovne ekscizije (BER) je sistem za popravilo DNA, ki se pojavi v celicah. | Popravilo nukleotidne ekscizije (NER) je druga vrsta sistema za popravilo DNA, ki ga najdemo v celicah. |
| Prepoznavanje aduktov DNA | |
| BER popravi škodo na majhnih aduktih DNA. | NER popravi velike adukte DNA. |
| Poškodbe DNK | |
| BER priznava škodo, ki ne povzroča večjega izkrivljanja vijačnice DNA. | NER priznava škodo, ki povzroči znatno izkrivljanje vijačnice DNA. |
| Vzroki za poškodbe DNK | |
| BER popravi škodo, ki so jo povzročili endogeni mutageni. | NER popravi škodo, ki jo povzročijo eksogeni mutageni. |
| Kompleksnost | |
| BER je najmanj zapleten sistem popravil | Je bolj zapleten kot BER. |
| Potreba po beljakovinah | |
| BER ne zahteva drugih beljakovin. | NER zahteva več genskih produktov, zlasti beljakovin, da bi razločeval poškodovane in nepoškodovane regije. |
| Primernost | |
| BER je primeren za odpravljanje enobarvne škode. | NER je primeren za nadomestitev poškodovanih predelov. |
Povzetek - Popravilo osnovne ekscizije v primerjavi z nukleotidnim ekscizijskim popravilom
NER in BER sta dve vrsti postopkov popravljanja ekscizije DNA, ki ju najdemo v celicah. BER lahko popravi majhne škode, ki jih povzroči endogeno, medtem ko NER lahko popravi škodo v območjih do 30 dolžin osnovnega para, ki jih večinoma povzročijo eksogeni. BER se razlikuje od NER po prepoznanih vrstah substratov in v začetnem dogodku cepitve. BER lahko prepozna tudi škodo, ki ni nastala zaradi večjega izkrivljanja v vijačnici DNA, medtem ko NER prepozna znatna izkrivljanja vijačnice DNA. To je razlika med popravilom izločanja baze in izločanjem nukleotidov.
Vljudnost slike:
1. „Izvleček baze za popravilo DNK en“avtor LadyofHats - (javna domena) prek Commons Wikimedia
2. „Shematski prikaz modelov poti popravljanja izrezov nukleotidov, ki jo nadzirajo proteini Uvr“Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui in Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) prek Commons Wikimedia
