Ključna razlika med CRISPR in restrikcijskimi encimi je, da je CRISPR naravni prokariontski imunski obrambni mehanizem, ki se pred kratkim uporablja za urejanje in modificiranje evkariontskih genov, restrikcijski encimi pa so biološke škarje, ki molekule DNA cepijo na manjše snovi.
Urejanje genoma in modifikacija genov sta zanimivi in inovativni področji genetike in molekularne biologije. Študije genske terapije pogosto uporabljajo modifikacijo genov. Poleg tega je modifikacija gena koristna pri ugotavljanju lastnosti gena, funkcionalnosti gena in kako bi mutacije v genu lahko vplivale na njegovo funkcijo. Pomembno je izvesti učinkovite in zanesljive načine za natančne, ciljno usmerjene spremembe v genomu živih celic. CRISPR in omejevalni encimi igrajo ključno vlogo pri modifikacijah genov. CRISPR zelo natančno spreminja gene. Restrikcijski encimi delujejo kot biološke škarje, ki molekule DNA cepijo na manjše snovi.
