Ključna razlika med kotransportom in nasprotnim prevozom je ta, da je kotransport oblika sekundarnega aktivnega transporta, ki prenaša dve vrsti molekul hkrati skozi plazemsko membrano v isto smer ali v nasprotno smer. Po drugi strani pa je nasprotni transport ena od dveh oblik kotransporta, ki prenaša dve vrsti molekul hkrati v nasprotni smeri med seboj po celični membrani.
Molekule vstopajo in izstopajo skozi selektivno plazemsko membrano celice. Obstaja več vrst proteinov, ki prenašajo membrano. Cotransport in countertransport sta dve vrsti sekundarnega aktivnega prevoza. Cotransport prenaša dve različni vrsti molekul hkrati v povezanem gibanju, medtem ko je nasprotni prevoz ali izmenjava vrsta cotransporta, ki prenaša dve vrsti molekul v nasprotni smeri čez membrano.