Ključna razlika med glioksisomi in peroksisomi je v tem, da so glikoksomi prisotni samo v rastlinskih celicah in nitastih glivah, medtem ko so peroksisomi prisotni v skoraj vseh evkariontskih celicah. Glioksisomov je veliko v rastlinskih celicah kalivih semen, peroksisomov pa v jetrnih in ledvičnih celicah.
Ti dve organeli sta mikro telesi, prisotni v evkariontskih celicah. Glioksisomi so specializirani peroksisomi, ki jih najdemo samo v rastlinskih celicah in nitastih glivah. Peroksisomi so organele, ki pomagajo razgraditi dolge verige maščobnih kislin in razstrupiti celico. Razgrajujejo alkohole in druge škodljive spojine.
