Ključna razlika - metabolomika vs metabonomija
Metaboliti so majhne molekule, ki sodelujejo v presnovnih reakcijah v celicah. Med presnovke spadajo presnovni intermediati, hormoni, sekundarni presnovki, signalne molekule itd. So delujoče molekule biokemičnih reakcij celic. Popoln nabor presnovkov biološkega vzorca ali posameznega organizma je znan kot metabolom. Metabolom je dinamična zbirka, ki se v telesu spreminja vsako sekundo. Metabolomika in metabonomija sta dva izraza, povezana s preučevanjem metaboloma v organizmu. Ključna razlika med metabolomiko in metabonomiko je v tem, da je metabolomika bolj zaskrbljena zaradi normalnega endogenega metabolizma in metaboličnega profiliranja na celični ali organski ravni, medtem ko se metabonomika bolj ukvarja s širjenjem presnovnega profiliranja z informacijami o motnjah metabolizma zaradi dejavnikov okolja, bolezni, črevesja mikroorganizmov in primerjava presnovnega profiliranja itd. Metabolomiko v glavnem poganja masna spektrometrija, metabonomija pa za analizo presnovkov uporablja NMR spektroskopijo.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj je metabolomika
3. Kaj je metabonomija
4. Vzporedna primerjava - Metabolomika vs metabonomija
5. Povzetek
Kaj je metabolomija?
Metabolomika je preučevanje presnovnih procesov, ki se pojavijo v celicah, biotekočinah, tkivih ali organizmih. Vključuje identifikacijo in količinsko opredelitev celičnih presnovkov z uporabo dobrih analitičnih in statističnih orodij. Metabolomika velja za pomembno študijo, saj razkriva informacije o presnovi organizma.
Za preučevanje substratov in produktov presnovnih reakcij metabolomika uporablja masno spektrometrijo kot analitično platformo. Masena spektrometrija razkriva vrste presnovkov in njihove koncentracije, ki odražajo dejansko biokemično stanje celic ali tkiv. Zato lahko presnovo štejemo za najboljšega predstavnika molekularnega fenotipa organizma. Metabolomika je omična tehnologija majhnih molekul organizmov v primerjavi z drugimi omičnimi študijami; metabolomija je zelo pomembna, saj neposredno odraža trenutno stanje biokemične reakcije celic.
Metabolomiko lahko štejemo tudi za podaljšek proteomike, ker nastaja zaradi aktivnosti encimov, ki so beljakovine, kot je prikazano na naslednji sliki.
Slika 01: Shema metabolomike
Kaj je Metabonomics?
Metabonomija je opredeljena kot kvantitativno merjenje večparametričnih presnovnih odzivov ob določenih časih glede na patofiziološke obremenitve ali genske spremembe. To se običajno uporablja za študije o prehrani ljudi in odzivih na zdravila ali bolezni. Ta pristop je bil pionir Jeremyja Nicholsona z Imperial College v Londonu in je bil uporabljen na številnih področjih, vključno s toksikologijo, diagnozo bolezni, prehrano itd. V preteklosti je bila metabonomija ena prvih metod, ki je uporabila področje sistemske biologije za študije presnove.
Metabonomiko bolj skrbi primerjava biokemijskih profilov kot pa ugotavljanje posameznih presnovnih spojin v metabolomiki. Zato lahko metabonomiko opredelimo kot podskupino metabolomike. Poudarja predvsem primerjavo presnovnih profilov različnih populacij glede na bolezni, okoljske obremenitve, genske spremembe, prehrano, zdravila itd., Ker so metaboliti dobri označevalci stanja bolezni, učinkov zdravil, okoljskih stresov, izpostavljenosti toksinom itd.
Metabonomske študije razkrivajo tako znotrajcelične kot zunajcelične presnovke. Uporablja tehnike prepustnosti za analizo velikega števila presnovkov hkrati in večkrat, kar omogoča časovno preiskavo fiziološkega stanja celic. Razkrije tudi povezavo med presnovki in patološkim stanjem organizma. Za podporo metabonomskim študijam je mogoče uporabiti genomiko in proteomiko, saj sta med seboj povezani, kot je prikazano na zgornji sliki.
Kakšna je razlika med metabolomiko in metabonomiko?
Diff Article Sredina pred mizo
Metabolomika vs Metabonomics |
|
| Metabolomika je preučevanje celotnega sklopa presnovkov v organizmu | Metabonomija je kvantitativna študija večparametričnih presnovnih odzivov živih sistemov v časovni osnovi na patofiziološke dražljaje ali genske spremembe. |
| Glavna skrb | |
| Metabolomika se bolj ukvarja s presnovnim profiliranjem in prepoznavanjem posameznih presnovkov, prisotnih v celicah. | Metabonomija se bolj ukvarja s primerjavo presnovkov ali presnovnih profilov populacij v povezavi z genskimi spremembami, boleznimi, obremenitvami okolja, patološkimi dražljaji, zdravili itd. |
| Informacije | |
| Presnova je osredotočena predvsem na endogeni metabolizem. | Metabonomija ni omejena na endogeni metabolizem. Razširja se tako, da najde informacije o motnjah presnove, ki jih povzročajo notranji in zunanji dejavniki, kot so prehranski vzorci, toksini, procesi bolezni itd. |
| Analitična orodja | |
| Kot glavno analitično platformo uporablja masno spektrometrijo | Metabonomics uporablja NMR spektroskopijo kot glavno analitično platformo. |
Povzetek - Metabolomika vs Metabonomics
Metabolom predstavlja celoten sklop majhnih molekul, imenovanih presnovki, prisotni v celici ali v organizmu. Metabolomika je preučevanje celotnega metaboloma za ustvarjanje presnovnega profila. Metabolomika znanstvenikom omogoča merjenje dejanskega fiziološkega stanja celice ali organizma. Metabonomija je del metabolomike, ki se razteza tako, da pridobiva informacije o večparametričnih presnovnih odzivih živih sistemov na patofiziološke dražljaje in genske spremembe. Metabonomija se ne ukvarja samo s posameznim presnovnim profiliranjem, kot je metabolomika; primerja presnovne profile z drugimi dejavniki, kot so obremenitve okolja, bolezni, toksini itd. Tako metabolomija kot tudi metabonomija vključujejo študije presnovkov organizmov za merjenje dejanskega fiziološkega stanja celic. Torej,včasih se to dvoje šteje za sopomenki, ne da bi upoštevali razliko med metabolomiko in metabonomiko.
