Ključna razlika - vektorji YAC proti BAC
Vektorji se uporabljajo pri molekularnem kloniranju. Vektor lahko definiramo kot molekulo DNA, ki se obnaša kot nosilec tujega genskega materiala v drugo celico. Vektor, ki vsebuje tujo DNA, je znan kot rekombinantna DNA in bi moral biti sposoben razmnoževanja in izražanja v gostiteljskem organizmu. Kvasni umetni kromosom (YAC) in bakterijski umetni kromosom (BAC) sta dve vrsti vektorjev, ki sodelujeta pri kloniranju. Ključna razlika med YAC in BAC je, da je YAC umetno zgrajen vektorski sistem, ki uporablja določeno regijo kvasnega kromosoma za vstavljanje velikih segmentov genskih materialov v kvasne celice, medtem ko je BAC umetno zgrajen vektorski sistem, ki uporablja določeno regijo kromosoma E. coli vstaviti velike segmente DNA v celice E. coli.
VSEBINA
1. Pregled in ključna razlika
2. Kaj so vektorji YAC
3. Kaj so vektorji BAC
4. Primerjava med seboj - vektorji YAC proti BAC
5. Povzetek
Kaj so vektorji YAC?
YAC (kvašeni umetni kromosom) je umetno zgrajen kromosom, ki ima sposobnost prenašanja velikega segmenta tuje DNA in replikacije znotraj kvasnih celic. Ima centromero, telomere, pa tudi avtonomno replicirajoča zaporedja, ki so bistvena za razmnoževanje in stabilnost. YAC mora imeti tudi selektivni marker ali označevalce in mesta omejitve, da postane učinkovit vektor kloniranja. Veliko zaporedje od 1000 kb do 2000 kb lahko vstavimo v YAC in prenesemo v kvas. Učinkovitost preoblikovanja YAC je zelo nizka.
Slika 01: Vektor YAC
Kaj so vektorji BAC?
Bakterijski umetni kromosom (BAC) je umetno zgrajen kromosom za molekularno kloniranje. Ima specifična področja plazmida E. coli F in je krožen in super navit. BAC je razvit za kloniranje fragmentov DNA bakterijam, zlasti E. coli. Lahko nosi fragmente DNA velikosti do 300 kb. V primerjavi z YAC so vložki za kloniranje BAC manjši. BAC so bili razviti leta 1992 in je še vedno priljubljen zaradi svoje stabilnosti in enostavnosti gradnje. BAC so koristni tudi pri razvoju cepiv.
Slika 02: Vektor BAC v molekularnem kloniranju
Kakšna je razlika med vektorji YAC in BAC?
Diff Article Sredina pred mizo
YAC vs BAC Vectors |
|
| YAC je gensko spremenjeni kromosom z uporabo DNA kvasovk za kloniranje. | BAC je gensko spremenjena molekula DNA, ki uporablja DNA E. coli za kloniranje. |
| Spol | |
| YAC so bili zasnovani za kloniranje velikih fragmentov genomske DNA v kvas. | BAC so bili razviti za kloniranje velikih genomskih fragmentov v Escherichia coli. |
| Dolžina vstavka | |
| YAC lahko vsebujejo genomske vložke v velikosti megabaze (1000 kb - 2000 kb). | BAC lahko vsebujejo vložke velikosti 200–300 kb ali manj. |
| Gradnja | |
| DNK YAC je težko očistiti nedotaknjeno in zahteva visoko koncentracijo za ustvarjanje vektorskega sistema YAC. | BAC je enostavno očistiti nedotaknjen in ga je mogoče enostavno izdelati. |
| Kimerizem | |
| YAC so pogosto himerni. | BAC so redko himerni. |
| Stabilnost | |
| YAC je nestabilen. | BAC je stabilen. |
| Spremembe | |
| Rekombinacija kvasa je zelo izvedljiva in vedno ostane aktivna. Zato lahko v YAC ustvari izbris in druge preureditve. | Rekombinacija E. coli je preprečena in se po potrebi vklopi. Tako zmanjšuje neželene prerazporeditve v BAC. |
| Vzdrževanje | |
| Manipulacija z rekombinantnimi YAC običajno zahteva prenos YAC v E. coli za nadaljnjo manipulacijo. Zato je to naporen proces. | Modifikacija BAC se pojavi neposredno pri E. coli. Prenosa DNK torej ni treba. Zato postopek ni naporen. |
Povzetek - YAC vs BAC Vectors
YAC je postal bistveno raziskovalno orodje v postopkih kloniranja zaradi svoje sposobnosti kloniranja velikih fragmentov DNA v gostiteljski organizem. Vendar imajo YAC več slabosti kot vektorji, kot so gradbene težave, kimerizem, nestabilnost itd. Zato so znanstveniki za premagovanje teh težav razvili vektorje BAC. BAC je bil zgrajen z uporabo posebnih regij kromosoma E. coli. Je stabilen vektor in ga je enostavno zgraditi. Vendar je dolžina DNA, s katero lahko BAC ravna, do 20-krat manjša od dolžine YAC. To je razlika med vektorskimi sistemi YAC in BAC. Danes je BAC v laboratorijih bolj priljubljen kot YAC.
