Ključna razlika med glikogenom in glukozo je v tem, da je glikogen polisaharid, ki shranjuje ogljikove hidrate v živalih in glivah, medtem ko je glukoza najpogostejši monosaharid, ki deluje kot primarni vir energije v celicah.
Ogljikovi hidrati so organske spojine, za katere so značilni ogljikovi, vodikovi in kisikovi elementi. Razmerje med vodikom in kisikom je 2: 1 v ogljikovih hidratih, podobno kot voda. Ogljikovi hidrati so zelo pomembne biološke spojine, saj so glavni vir energije in strukturna sestavina protoplazme. Ogljikovi hidrati so na splošno beli, trdni in topni v organskih tekočinah, razen v nekaterih polisaharidih. Monosaharidi so osnovne enote molekul ogljikovih hidratov, glukoza pa je najpomembnejša med njimi. Glikogen je tudi ogljikov hidrat. Toda to je polisaharid, ki nastane z anabolizmom molekul glukoze v razvejano molekulo. Tako glukoza kot glikogen sta pomembna za proizvodnjo energije v telesu. Glukoza je glavno gorivo za proizvodnjo energije, glikogen pa je vrsta sekundarne,dolgoročno shranjevanje energije pri živalih in glivah.
