Ključna razlika med asimilacijskim in disimilatornim reduciranjem sulfata je v tem, da asimilacijski redukcijski sulfat tvori cistein kot končni produkt, medtem ko disimilacijski sulfatni redukcijski izdelek daje sulfid kot končni produkt.
Zmanjšanje sulfata je ena glavnih anaerobnih dihalnih poti. Poleg tega lahko nekateri mikrobi, ki so odvisni od anaerobnih pogojev, zmanjšajo sulfate, da pridobijo energijo. Poleg tega obstajata dve glavni poti, pri katerih se sulfati reducirajo; so asimilacijska pot in disimilacijska pot. Pri asimilacijski poti pa redukcija sulfata daje cistein kot končni produkt, ki ga lahko asimiliramo v živih organizmih, kot so rastline in višji evkarionti. Nasprotno, disimilacijska pot redukcije sulfata daje sulfid kot končni produkt. Zato je najpomembnejša, razločevalna razlika med asimilacijskim in disimilatornim reduciranjem sulfata vrsta končnega proizvoda, ki ga vsak pridela.
