Ključna razlika med heksokinazo in glukokinazo je, da je heksokinaza prisotna v vseh tkivih razen v jetrih in beta celicah trebušne slinavke, medtem ko je glukokinaza prisotna samo v jetrih in beta celicah trebušne slinavke.
Heksokinaza in glukokinaza sta dva izoencima, ki katalizirata isto reakcijo na dveh različnih mestih. Glukozo pretvorijo v glukozo 6-fosfat, kar je prva reakcija glikolize. Zato z uporabo ATP dodajo fosfatno skupino glukozi in spremenijo strukturo. Vendar imata ta dva encima podobnosti in razlike, o katerih bomo razpravljali tukaj.