Razlika Med CRISPR In RNAi

2024 Avtor: Mildred Bawerman | [email protected]. Nazadnje spremenjeno: 2023-12-16 08:42

Ključna razlika - CRISPR vs RNAi

Urejanje genoma in modifikacija genov sta prihodnji zanimivi področji genetike in molekularne biologije. Modifikacija genov je široko uporabna za študije genske terapije in se uporablja tudi za prepoznavanje lastnosti gena, funkcionalnosti gena in kako bi mutacije v genu lahko vplivale na njegovo funkcijo. Pomembno je razviti učinkovite in zanesljive načine za natančne, ciljno usmerjene spremembe v genomu živih celic. Tehnike, kot sta CRISPR in RNAi, se uporabljajo za visoko natančno spreminjanje genov. CRISPR ali Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats je naravni prokariontski imunski obrambni mehanizem, ki se pred kratkim uporablja za urejanje in spreminjanje evkariontskih genov. Interferenca RNAi ali RNA je za zaporedje specifična metoda za utišanje genov z uvedbo majhne dvoverižne RNA, ki posreduje z nukleinskimi kislinami in uravnava izražanje genov. To je ključna razlika med CRISPR in RNAi.

VSEBINA

1. Pregled in ključna razlika

2. Kaj je CRISPR

3. Kaj je RNAi

4. Podobnosti med CRISPR in RNAi

5. Vzporedna primerjava - CRISPR v primerjavi z RNAi v tabelarni obliki

6. Povzetek

Kaj je CRISPR?

Sistem CRISPR je naravni mehanizem, ki je prisoten v nekaterih bakterijah, vključno z E. coli in arheo. Je prilagodljiva imunska zaščita pred invazijami, ki temeljijo na tuji DNK. Je mehanizem, specifičen za zaporedje. Sistem CRISPR vsebuje več ponovitvenih elementov DNA. Ti elementi so posejani s kratkimi zaporedji "distančnika", pridobljenimi iz tuje DNA in več Cas genov. Nekateri Cas geni so nukleaze. Tako se celoten imunski sistem imenuje sistem CRISPR / Cas.

Slika 01: Sistem CRISPR / Cas

Sistem CRISPR / Cas deluje v štirih korakih.

1. Sistem genetsko veže invadirajoče fage in segmente plazmidne DNA (distančnike) v lokuse CRISPR (imenovan korak pridobivanja distančnika).
2. korak zorenja crRNA - gostitelj prepiše in obdela lokuse CRISPR, da ustvari zrelo CRISPR RNA (crRNA), ki vsebuje tako ponovne elemente CRISPR kot integrirane distančne elemente.
3. Odkrivanje crRNA - To olajša komplementarno seznanjanje baz. To je pomembno, kadar je prisotna okužba in je nalezljiv povzročitelj.
4. Korak ciljne interference - crRNA zazna tujo DNA, tvori kompleks s tujo DNA in gostitelja zaščiti pred tujo DNA.

Trenutno se sistem CRISPR / Cas uporablja za spreminjanje ali spreminjanje genoma sesalcev bodisi z represijo transkripcije bodisi z aktivacijo. Celice sesalcev se lahko odzovejo na prelome DNA, posredovane s CRISPR / Cas9, s sprejetjem mehanizma za popravilo. To je mogoče izvesti z uporabo nehomologne metode končnega spajanja (NHEJ) ali popravila, usmerjenega s homologijo (HDR). Oba mehanizma za popravilo se izvedeta z uvedbo dvoveričnih prekinitev. Rezultat tega je urejanje gena sesalcev. Tako se trenutno sistem CRISPR / Cas uporablja na področju terapevtske, biomedicinske, kmetijske in raziskovalne uporabe.

Kaj je RNAi?

Interferenca RNA je dvoverižna tehnika, posredovana z RNA, ki se uporablja za uravnavanje izražanja genov. Glavna spojina je majhna moteča RNA (siRNA). SiRNA so posebna vrsta dvoverižnih RNA s 3 'previsom dveh nukleotidov in 5' fosfatno skupino. RNA-inducirani dušilni kompleks (RISC) nastane med interferenco RNA, kar bi povzročilo razgradnjo gena, vezanega na siRNA.

Slika 02: RNAi

Postopek RNAi je naslednji.

1. Dvoverižna RNA bo v citoplazmi obdelana z endoribonukleazo tipa RNase III, imenovano Dicer, da ustvari ~ 21 nukleotidnih dolgih siRNA
2. Prenos siRNA vezanega Dicerja v Argonaute s pomočjo dvoverižnih RNA vezavnih proteinov (dsRNABP).
3. Vezava Argonauta na en pramen dupleksa (vodilni pramen). To bo premaknilo drugi pramen. Rezultat tega je celoten kompleks protein - RNA, ki se imenuje RISC.
4. Seznanjavanje kompleksa RISC z enoverižno vodilno RNA, vezano na Argonaute.
5. Seznanitev homologne tarče RNA z vodilno RNA.
6. Aktivacija Argonauta, ki povzroči razgradnjo ciljne RNA

Kakšna je podobnost med CRISPR in RNAi?

Oba se uporabljata kot raziskovalno orodje za spreminjanje izražanja genov

Kakšna je razlika med CRISPR in RNAi?

Diff Article Sredina pred mizo

CRISPR vs RNAi
CRISPR je mehanizem imunske obrambe, ki se pred kratkim uporablja za urejanje in spreminjanje evkariontskih genov.	RNAi je metoda, specifična za zaporedje, za utišanje genov z uvedbo majhnih dvoverižnih
Zaporedje ciljanja
Sintetična RNA (vodilna RNA) je ciljno zaporedje CRISPR.	siRNA je ciljno zaporedje RNAi.
Učinkovitost pri zatiranju genov
Nizko v CRISPR	Visoko v RNAi
Učinki
Knockdown genov se zgodi v CRISPR.	Izločanje / utišanje se pojavi v RNAi.

Povzetek - CRISPR vs RNAi

CRISPR ali Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats je naravni prokariontski imunski obrambni mehanizem, ki se v zadnjem času uporablja za urejanje in spreminjanje evkariontskih genov. Interferenca RNAi ali RNA je za zaporedje specifična metoda za utišanje genov z uvedbo majhne dvoverižne RNA, ki posreduje z nukleinskimi kislinami in uravnava izražanje genov. To lahko razumemo kot osnovno razliko med CRISPR in RNAi. Obe tehniki, CRISPR / Cas in RNAi, sta močni orodji za genske manipulacije, čeprav je CRISPR / Cas zagotovo boljši od RNAi, saj se lahko uporablja za induciranje vstavitev in odstranitev. Posebnost je velika tudi v sistemu CRISPR / Cas.

Prenesite PDF različico CRISPR vs RNAi

Lahko prenesete različico tega članka v obliki PDF in jo uporabite za uporabo brez povezave, kot je navedeno v opombi. Prosimo, prenesite PDF različico tukaj Razlika med CRISPR in RNAi