Ključna razlika med prebavo heterotrofov in saprotrofov je v tem, da je prebava heterotrofov znotrajcelična, medtem ko je prebava saprotrofov zunajcelična.
Prebava je pomemben proces za preživetje organizmov. S tem postopkom postanejo hranila na voljo za absorpcijo v organizmih. Heterotrofna prebava je proces znotrajcelične prebave v organizmih, ki je odvisen od organske hrane. Saprotrofna prebava je postopek zunajcelične prebave, kjer so organizmi odvisni od odmrle organske snovi. Prebava heterotrofov in saprotrofov je pomembna za preživetje biosfere. Heterotrofi so odvisni od organskih snovi iz rastlin in drugih živalskih virov. Po drugi strani pa so saprotrofi pri prehrani neposredno odvisni od odmrle organske snovi. Zato učenje teh prebavnih vzorcev pomaga pri preučevanju prehranskih odnosov v organizmih.